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火博体育大学
化学系
K. 水母球

K. 水母球

化学系副教授兼系主任

办公室:顺310d
电话: 518-580-8191
电子邮件: kball@zizhanggui.com

2016年起在Skidmore工作

研究小组网页

教育

  • B.A. 2007年,米德尔伯里学院物理系
  • Ph.D. 生物物理学2013,加州大学伯克利分校
  • 2013-2016美国加州大学旧金山分校博士后研究员
  • 2015-2016美国国立卫生研究院国家研究服务奖博士后,加州大学 旧金山

研究

我的计算生物化学研究项目使用计算机模拟和其他 如何用计算方法来研究 内在无序蛋白(IDPs) 在疾病的情况下与折叠蛋白相互作用,或作为正常细胞的一部分 函数. IDPs不同于典型的折叠蛋白,因为它们缺少一个单核苷酸 定义良好的结构,而不是动态地占用许多替代结构. 这 研究利用了物理学、化学、生物学和计算机科学的知识 了解控制无序之间相互作用的基本物理原理 折叠的蛋白质以及这些相互作用对它们的功能有多么重要. 一个 目前的项目研究作为HIV病毒一部分的IDP如何与折叠蛋白相互作用 改变人类蛋白质的结构、动力学和功能. 我研究的学生 小组将从物理和生物的角度研究重要的IDP相互作用 从化学角度出发,学习有价值的计算技能. 应用相关概念 对物理化学,统计力学,经典和量子物理的学生 将模拟蛋白质及其相互作用. 此外,学生将有机会 开发蛋白质动力学分析的新方法,并与结构 生物学家,生物化学家和计算化学家. 小组中的学生也可以 有机会对他们的计算结果进行实验验证吗 使用二维生物核磁共振或其他方法.
 
我正在招募对生物物理研究感兴趣的火博体育大学本科生 学习计算机技能,加入我的实验室. 不需要经验.

课程

  • 化学原理(讲座和实验)
  • CH 332物理化学I(实验室)
  • CH 333物理化学II(讲座和实验)
  • ch343实验生物化学实验室

入选出版物(*表示本科合作作者)

  • K. A. 球, L. M. 陈* D. J. 斯坦利,E. Tierney *,年代. Thapa * H. M. 助教,我. A. 伯顿J. M. 装箱,M. P. 雅各布森J. D. 总值. HIV Vif蛋白的构象动力学 复杂的. 生物物理期刊, 2019; 116.  (link)
  • K. 水母球杰弗里·R. 玛丽·约翰逊. Lewinski, John Guatelli, Erik Verschueren, Nevan J. Matthew P . Krogan. 雅各布森. 蛋白激酶的非降解泛素化. PLoS计算生物学, 2016; 12:e1004898.
  • Sudhir C. 夏尔马,塔拉·阿曼德*, K. 水母球,安娜·陈*,杰弗里·G. 大卫·佩尔顿. 温默,我是特蕾莎·海德·戈登. 简单的方法 用于表达和纯化15N同位素标记的人阿尔茨海默病β-淀粉样蛋白 肽从 E. 杆菌 进行核磁共振结构分析. 蛋白表达与纯化; 2015; 116:82-89.
  • K. 水母球大卫·E. 温默,我是特蕾莎·海德·戈登. 结构测定方法的比较 内在无序淀粉样蛋白-β肽. 物理化学学报B; 2014; 118:6405-6416.
  • Tandis Vazin, K. 水母球,陆慧,朴亨柱,Yasaman Ataeijannati特蕾莎·海德·戈登, Poo Mu-ming, David V. 谢弗. 多能性人皮层谷氨酸能神经元的高效衍生 干细胞:研究阿尔茨海默病神经毒性的模型系统. 疾病神经生物学, 2014; 62:62-72.
  • K. 水母球亚伦·H. 大卫·菲利普斯. 温默,我是特蕾莎·海德·戈登. β-链的差异 单体Aβ40和Aβ42居群. 生物物理期刊 2013; 104:2714-2724. 特刊封面.
  • K. 水母球亚伦·H. 保罗·S·菲利普斯. 尼伯格,尼古拉斯·L. 大卫·法齐. 的电话,特蕾莎修女 Head-Gordon. 淀粉样蛋白b的均匀和非均匀三级结构集合 肽. 生物化学、 2011; 50:7612-7628.
  • 乔Z. 乔纳森·E·鲁西奥. 科恩, K. 水母球特蕾莎·海德·戈登. 蛋白质动力学对计算成功的影响 酶的设计. Journal of the American Chemical Society, 2009; 131:14111-14115.

社会兼职

  • 美国化学学会(计算化学)
  • 生物物理学会(内在无序蛋白质)